XP 的計算機上對磁盤分區的三個文件系統進行選擇：NTFS、FAT 和 FAT32。現通過下列信息對文件系統加以比較。
建議使用 NTFS 文件系統的原因如下：
NTFS 比 FAT 或 FAT32 的功能更強大，它包括提供 所需的功能以及其他重要安全性功能。只有選擇 NTFS 作為文件系統才能使用諸如 和基于域的安全性等功能。
將分區轉換為 NTFS 很容易。使用“安裝”程序可以很容易地進行轉換，不論您使用的是 FAT 還是 FAT32 或較低版本的 NTFS。這種轉換可以保持您的文件不發生變化（不像格式化分區）。如果不需要使文件保持原樣，且已擁有 FAT 或 FAT32 分區，則建議使用 NTFS 來格式化分區而不是從 FAT 或 FAT32 進行轉換。格式化分區會刪除分區上的所有數據，使您能夠從一個清空的驅動器開始進行操作。
不論是用 NTFS 格式化分區還是使用轉換命令進行轉換，NTFS 都是文件系統的最佳選擇。有關 .exe 的詳細信息，在完成“安裝”后，請依次單擊“開始”、“運行”，鍵入 cmd，然后按 ENTER。在命令窗口，鍵入 help ，然后按 ENTER。
要維護文件和文件夾訪問控制并支持有限個帳戶，必須使用 NTFS。如果使用 FAT32系統盤的格式是什么，所有用戶都將具有訪問權，以訪問您的硬盤驅動器上的所有文件系統盤的格式是什么，而不考慮其帳戶類型（管理員、有限制的或標準的）。
NTFS 是一種最適合處理大磁盤的文件系統。（下一個性能僅次于 NTFS 并適于處理大磁盤的文件系統是 FAT32。）
有一種情況可能需要將 FAT 或 FAT32 選為您的文件系統。如果必須有一臺有時運行較低版本的 ，其他時間運行 XP 的計算機，則需要使用 FAT 或 FAT32 分區作為其硬盤上的主（或啟動）分區。如果使用最新版本的 NTFS，則多數較低版本的 將無法訪問這個分區。兩種例外情況是 2000 和具有 Pack 4（或更新版本）的 NT 4.0。具有 Pack 4（或更新版本）的 NT 4.0 對具有最新版本 NTFS 的分區有訪問權限，但是有某些限制：它不能訪問使用在 NT 4.0 發布時，尚未可用的 NTFS 功能存儲的文件。
但對于其他包含多個操作系統的情況，推薦的文件系統依然是 NTFS。
要點
一旦將驅動器或分區轉換為 NTFS，則無法將其簡單地轉換回 FAT 或 FAT32。需要重新格式化驅動器或分區，這樣將刪除該分區上包括應用程序和個人文件在內的所有數據。
下面的表格介紹了每個文件系統與各種操作系統的兼容性。
NTFS
運行 XP 或 2000 的計算機可以訪問 NTFS 分區上的文件。運行帶有 Pack 4（或更高版本）的 NT 4.0 的計算機可能可以訪問某些文件。其他操作系統則無法訪問。
FAT
可以通過 MS-DOS、 的所有版本、 NT、 2000、 XP 和 OS/2 進行訪問。
FAT32
僅可以通過 95 OSR2、 98、 、 2000 和 XP 進行訪問。
下表比較了每種文件系統支持的磁盤和文件大小。
NTFS
推薦的最小卷大小約為 10 MB，
也可使用大于 2 TB 的卷。
無法在軟盤上使用。
文件大小只受卷的容量限制。
FAT
容量可從軟盤大小到 4 GB。
不支持域。
最大文件大小為 2 GB。
FAT32
卷的容量從 512 MB 到 2 TB。
在 XP 中，只能格式化最大到 32 GB 的 FAT32 卷。
不支持域。
最大文件大小為 4 GB。